MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 41104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_015562	TAA	2	6	1849640	1849645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333911662
41002	NC_015562	A	6	6	1849653	1849658	100 %	0 %	0 %	0 %	333911662
41003	NC_015562	GTT	2	6	1849660	1849665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333911662
41004	NC_015562	AAAG	2	8	1849683	1849690	75 %	0 %	25 %	0 %	333911662
41005	NC_015562	AG	3	6	1849697	1849702	50 %	0 %	50 %	0 %	333911662
41006	NC_015562	AAATA	2	10	1849713	1849722	80 %	20 %	0 %	0 %	333911662
41007	NC_015562	AAAAGA	2	12	1849734	1849745	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	333911662
41008	NC_015562	A	7	7	1849776	1849782	100 %	0 %	0 %	0 %	333911662
41009	NC_015562	TTAA	2	8	1849783	1849790	50 %	50 %	0 %	0 %	333911662
41010	NC_015562	GAT	2	6	1849804	1849809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333911662
41011	NC_015562	GAGGCA	2	12	1849852	1849863	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	333911662
41012	NC_015562	GAA	2	6	1849965	1849970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333911662
41013	NC_015562	GAA	2	6	1849972	1849977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333911662
41014	NC_015562	TAT	2	6	1849981	1849986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333911662
41015	NC_015562	CATG	2	8	1850022	1850029	25 %	25 %	25 %	25 %	333911662
41016	NC_015562	AAC	2	6	1850109	1850114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333911662
41017	NC_015562	ATA	2	6	1850131	1850136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333911662
41018	NC_015562	A	6	6	1850180	1850185	100 %	0 %	0 %	0 %	333911662
41019	NC_015562	GTTT	2	8	1850269	1850276	0 %	75 %	25 %	0 %	333911662
41020	NC_015562	TGA	2	6	1850292	1850297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333911662
41021	NC_015562	GAA	2	6	1850379	1850384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333911662
41022	NC_015562	AT	3	6	1850397	1850402	50 %	50 %	0 %	0 %	333911662
41023	NC_015562	AAT	2	6	1850409	1850414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333911662
41024	NC_015562	TGA	2	6	1850433	1850438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333911662
41025	NC_015562	AG	3	6	1850516	1850521	50 %	0 %	50 %	0 %	333911662
41026	NC_015562	A	7	7	1850595	1850601	100 %	0 %	0 %	0 %	333911662
41027	NC_015562	GAA	2	6	1850619	1850624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333911662
41028	NC_015562	A	7	7	1850631	1850637	100 %	0 %	0 %	0 %	333911662
41029	NC_015562	AGA	2	6	1850678	1850683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333911662
41030	NC_015562	GA	3	6	1851171	1851176	50 %	0 %	50 %	0 %	333911663
41031	NC_015562	AGATA	2	10	1851229	1851238	60 %	20 %	20 %	0 %	333911663
41032	NC_015562	GAA	2	6	1851266	1851271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333911663
41033	NC_015562	AGA	2	6	1851279	1851284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333911663
41034	NC_015562	GGA	2	6	1851299	1851304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333911663
41035	NC_015562	A	7	7	1851325	1851331	100 %	0 %	0 %	0 %	333911663
41036	NC_015562	GGAA	2	8	1851333	1851340	50 %	0 %	50 %	0 %	333911663
41037	NC_015562	AAT	2	6	1851362	1851367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333911663
41038	NC_015562	AAG	2	6	1851428	1851433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333911663
41039	NC_015562	TTG	2	6	1851462	1851467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333911663
41040	NC_015562	AAG	2	6	1851486	1851491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333911663
41041	NC_015562	AACC	2	8	1851527	1851534	50 %	0 %	0 %	50 %	333911663
41042	NC_015562	TGC	2	6	1851547	1851552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911663
41043	NC_015562	T	7	7	1851561	1851567	0 %	100 %	0 %	0 %	333911663
41044	NC_015562	AAT	2	6	1851625	1851630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333911663
41045	NC_015562	A	6	6	1851644	1851649	100 %	0 %	0 %	0 %	333911663
41046	NC_015562	TTA	2	6	1851654	1851659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333911663
41047	NC_015562	A	7	7	1851661	1851667	100 %	0 %	0 %	0 %	333911663
41048	NC_015562	CATT	2	8	1851917	1851924	25 %	50 %	0 %	25 %	333911664
41049	NC_015562	T	6	6	1851944	1851949	0 %	100 %	0 %	0 %	333911664
41050	NC_015562	CAC	2	6	1851950	1851955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911664
41051	NC_015562	TA	3	6	1852010	1852015	50 %	50 %	0 %	0 %	333911664
41052	NC_015562	TC	3	6	1852018	1852023	0 %	50 %	0 %	50 %	333911664
41053	NC_015562	TG	3	6	1852056	1852061	0 %	50 %	50 %	0 %	333911664
41054	NC_015562	TTC	2	6	1852215	1852220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333911664
41055	NC_015562	TC	3	6	1852227	1852232	0 %	50 %	0 %	50 %	333911664
41056	NC_015562	TAT	2	6	1852245	1852250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333911664
41057	NC_015562	AT	3	6	1852249	1852254	50 %	50 %	0 %	0 %	333911664
41058	NC_015562	ATT	2	6	1852288	1852293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333911664
41059	NC_015562	T	7	7	1852323	1852329	0 %	100 %	0 %	0 %	333911664
41060	NC_015562	T	6	6	1852434	1852439	0 %	100 %	0 %	0 %	333911664
41061	NC_015562	TTC	2	6	1852446	1852451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333911664
41062	NC_015562	TA	3	6	1852481	1852486	50 %	50 %	0 %	0 %	333911664
41063	NC_015562	TGTGTA	2	12	1852548	1852559	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333911664
41064	NC_015562	TCA	2	6	1852633	1852638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333911664
41065	NC_015562	C	6	6	1852693	1852698	0 %	0 %	0 %	100 %	333911664
41066	NC_015562	T	7	7	1852747	1852753	0 %	100 %	0 %	0 %	333911664
41067	NC_015562	GAT	2	6	1852774	1852779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333911664
41068	NC_015562	CCA	2	6	1852810	1852815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333911664
41069	NC_015562	TAT	2	6	1852895	1852900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333911664
41070	NC_015562	TTC	2	6	1852908	1852913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333911664
41071	NC_015562	CTT	2	6	1852925	1852930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333911664
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41074	NC_015562	TAA	2	6	1853105	1853110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333911665
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41077	NC_015562	TCT	2	6	1853159	1853164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333911665
41078	NC_015562	TCC	2	6	1853191	1853196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333911665
41079	NC_015562	ACA	2	6	1853215	1853220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333911665
41080	NC_015562	CT	4	8	1853235	1853242	0 %	50 %	0 %	50 %	333911665
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41082	NC_015562	T	6	6	1853347	1853352	0 %	100 %	0 %	0 %	333911665
41083	NC_015562	ATC	2	6	1853430	1853435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333911665
41084	NC_015562	TTC	2	6	1853438	1853443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333911665
41085	NC_015562	CT	3	6	1853471	1853476	0 %	50 %	0 %	50 %	333911665
41086	NC_015562	TC	3	6	1853480	1853485	0 %	50 %	0 %	50 %	333911665
41087	NC_015562	AT	3	6	1853486	1853491	50 %	50 %	0 %	0 %	333911665
41088	NC_015562	TTGTT	2	10	1853564	1853573	0 %	80 %	20 %	0 %	333911666
41089	NC_015562	ATA	2	6	1853624	1853629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333911666
41090	NC_015562	TA	3	6	1853628	1853633	50 %	50 %	0 %	0 %	333911666
41091	NC_015562	TAA	2	6	1853636	1853641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333911666
41092	NC_015562	TTC	2	6	1853693	1853698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333911666
41093	NC_015562	TGA	2	6	1853699	1853704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333911666
41094	NC_015562	T	6	6	1853705	1853710	0 %	100 %	0 %	0 %	333911666
41095	NC_015562	TCA	2	6	1853760	1853765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333911666
41096	NC_015562	T	7	7	1853767	1853773	0 %	100 %	0 %	0 %	333911666
41097	NC_015562	TGT	2	6	1853791	1853796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333911666
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41100	NC_015562	TAT	2	6	1853906	1853911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333911666
41101	NC_015562	T	6	6	1853950	1853955	0 %	100 %	0 %	0 %	333911666
41102	NC_015562	TTTA	2	8	1853966	1853973	25 %	75 %	0 %	0 %	333911666
41103	NC_015562	TG	3	6	1853978	1853983	0 %	50 %	50 %	0 %	333911666
41104	NC_015562	GCT	2	6	1854021	1854026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333911666

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.